Topic: Simulazione metabolismo cellulare in Python  (Letto 955 volte)

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Offline ms_bio

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Simulazione metabolismo cellulare in Python
« il: Marzo 19, 2014, 17:26 »
Ciao a tutti!!!
premetto che ho iniziato da poco ad utilizzare Python!  :O
Devo realizzare un progetto che prevede la simulazione del metabolismo di una cellula. Ho a disposizione le reazioni biochimiche che regolano il metabolismo e le corrispondenti equazioni differenziali. Come implementereste queste equazioni differenziali in Python? Esiste un tool di Simulazione o delle librerie che potrebbero essere utili??
Grazie  :) :)

Offline giovanni106

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Re: Simulazione metabolismo cellulare in Python
« Risposta #1 il: Dicembre 04, 2015, 10:24 »
Non so se esistano librerie con funzioni apposite, ma ti consiglio di cercare su google il metodo di eulero per la risoluzione di eq differenziali,è abbastanza semplice da implementare. Credo che con le solite librerie scientifiche numpy, scipy ecc dovresti cavartela.

Offline Python

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Re: Simulazione metabolismo cellulare in Python
« Risposta #2 il: Dicembre 04, 2015, 11:08 »
Con una rapida ricerca ho trovato questo:
https://github.com/PySCeS/pysces

Ma è testato solo con Python 2.7, nonostante sembra esserci attività recente.